Neben Dahme, Havel und Spree fließen auch kleinere Flüsse durch die Hauptstadt. In Berlin gibt es rund 30 Seen und Fließgewässer sowie mehr als 700 Klein- und Kleinstgewässer, die wertvolle Lebensräume bilden. Stadtgewässer können Hotspots der Artenvielfalt sein, wenn sie geschützt und gepflegt werden. Gewässerschutz heißt aber auch, natürliche Trinkwasserressourcen, grundwasserabhängige Moore, Auen und Wälder zu erhalten.
Gewässer beherbergen eine große Vielfalt an Arten – in Berlin wurden bisher 13 Amphibienarten, 61 Libellenarten und 26 heimische Fischarten registriert. Auch Säugetiere wie Biber und Fischotter sowie unzählige Pflanzenarten sind auf diesen Lebensraum angewiesen. Flüsse und Seen tragen außerdem zur Regulierung des Mikroklimas bei, dienen dem Hochwasserschutz bei Starkregenereignissen und bieten Möglichkeiten zur Naherholung.
Gleichzeitig sind viele Gewässer erheblichen Belastungen ausgesetzt. Alle größeren Wasserläufe und Seen verfehlen derzeit die Umweltanforderungen der EU-Wasserrahmenrichtlinie. Ein Großteil leidet unter Trockenheit und sinkenden Grundwasserständen, besonders Kleingewässer sind betroffen. Dadurch verschwinden Lebensräume und die lokale Biodiversität geht zurück. Straßenabwässer und Fehleinleitungen tragen zur Verschlechterung der Wasserqualität bei: Gelangt schadstoff- und nährstoffreiches Wasser in die Gewässer, begünstigt dies Algenwachstum, Faulschlammbildung und Sauerstoffmangel. Mikroplastik, Überwärmung sowie die intensive Nutzung durch Schifffahrt, Badegäste und Angelnde setzen den Gewässern weiter zu.
Um den Zustand der Gewässer zu verbessern, sind verschiedene Maßnahmen notwendig. Dazu gehören eine regelmäßige Dokumentation und Berichterstattung über ihren Zustand sowie die Einhaltung der EU-Vorgaben. Morphologische Aufwertungsmaßnahmen wie die Stabilisierung und Pflanzung von Röhricht können die Struktur der Gewässer verbessern. Auch der Bau von Regenrückhaltebecken, die verschmutztes Regenwasser vor der Einleitung reinigen, und Pflegearbeiten wie das Entfernen invasiver Pflanzenarten tragen zum Schutz und zur ökologischen Aufwertung der Gewässer bei.
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